Em Star Wars: The Clone Wars atravessas uma galáxia onde heróis Jedi icónicos utilizam os mecanismos de jogabilidade familiares da série Pandemic.
Os planetas sob cerco povoam o tabuleiro do jogo enquanto os jogadores assumem o papel de lendários Jedi que viajam de batalha em batalha, unindo-se e lutando contra a ameaça separatista. Os droides de combate atacam à vista, e um planeta invadido por demasiados cairá sob um bloqueio, impedindo os Jedi de o libertar do inimigo ou de completar missões.
Os jogadores devem trabalhar em conjunto para enfrentar o ataque de droides, movendo-se para os seus espaços e envolvendo-os em combate, utilizando dados e cartas de esquadrão para causar danos e repelir a ameaça. Entre as batalhas, os jogadores deslocam-se de planeta em planeta, combatendo mais droides, quebrando bloqueios, completando missões para inverter o curso da guerra e enfrentando vilões icónicos.
